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20210413

CRISPR-CAS9


En la película Gattaca, del ya lejano año 1997, se ilustraba una sociedad futura en la cual la mayor parte de los niños eran concebidos in vitro y con técnicas de selección genética que permitían a los padres “diseñar” su progenie de manera que estos contaran con todas las características deseables de ambos progenitores y sin ninguna que pudiera ser perjudicial, incluyendo enfermedades con componentes hereditarios como el asma. ¿Qué tan cerca estamos hoy en día de esa realidad? En el siguiente artículo lo vamos a descubrir.

El acrónimo CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats), que puede traducirse como “Repeticiones Palindrómicas Cortas Agrupadas y Regularmente Interespaciadas” hace referencia una serie de secuencias de ADN que precisamente cuentan con esas características; se “leen” igual en sentido 5’-3’ y en sentido 3’-5’ (Figura 1) y están repetidas y separadas en forma regular a lo largo del genoma de muchas bacterias, en las cuales constituyen una mecanismo de defensa ante infecciones víricas, conjuntamente con una serie de proteínas con actividad endonucleasa conocidas como Cas (CRISPR-associated), de las cuales la primera en ser utilizada en aplicaciones biotecnológicas fue la Cas 9, aunque en la actualidad se han descrito otras, por lo cual muchas veces se hace referencia a este mecanismo como CRISPR-Cas o simplemente sistema CRISPR. De manera concreta, en la naturaleza los sistemas CRISPR-Cas son sistemas de respuesta inmune adaptativa procariota que se encuentran en una amplia proporción de las especies bacterianas y en casi todas las especies de arqueas que se han secuenciado hasta la fecha.

Figura 1. Ejemplo de una secuencia 
palindrómica de ADN.

La maquinaria molecular involucrada en la inmunidad adquirida por el mecanismo CRISPR-Cas está codificada por el locus CRISPR como dos conjuntos de componentes genéticos que a menudo se...

20190701

Microbioma humano: Un universo en nuestro interior.


Sabemos desde hace siglos que los animales, incluido el ser humano, son portadores de muchos microorganismos distintos que hasta hace muy poco tiempo habían sido tratados con gran indiferencia. Sin embargo, en los últimos años gracias a las nuevas técnicas de secuenciación masiva que nos permiten estudiar las comunidades microbianas sin necesidad de cultivarlas, comenzamos a saber que para el desarrollo normal y el mantenimiento de la salud dependemos de nuestros microbios. La microbiota es el conjunto de microorganismos (bacterias, arqueas, virus, hongos y protistas), que residen en nuestro cuerpo. A veces se confunde con el término microbioma, que es mucho más amplio y hace referencia al conjunto de esas comunidades microbianas incluyendo sus genes y metabolitos, así como las condiciones ambientales que les rodean. Estos ecosistemas microbianos se encuentran en el tracto gastrointestinal, genitourinario y respiratorio, la cavidad oral y nasofaríngea, y la piel. 

Durante años se ha hecho popular la idea de que tenemos diez veces más bacterias en nuestro cuerpo que células humanas, que el 90% de nuestras células son bacterias. Sin embargo, según los últimos cálculos, aproximadamente la mitad de las células de nuestro cuerpo son microbios: 3,8 x 1013 bacterias y 3 x 1013 células humanas, una bacteria por cada célula humana. Esto puede parecer poco, pero tenemos la misma cantidad de bacterias que de células humanas: somos mitad humano mitad bacteria. El ser humano, por tanto, no es...