20210428

Evolución de la Pandemia

Día 27 de abril 2021. 1 año y 43 días después del primer Estado de Alarma

Evolución datos Coronavirus. (Las cifras representan datos acumulados de las tres últimas semanas, de lunes a lunes, separados por barras):

C.VALENCIANA:
Gráfico 1

Nuevos contagios detectados por todo tipo de test en una semana: 1262/1145/1130. Cinco semanas subiendo, con acelerón esta última. (+117, un 10,2%. Las semanas anteriores +1,3%, +8,5%, +10,3%). Gráfico 1.

Nuevos contagios detectados por PCR+ y antígenos (últ.14 días): 2417/2276/2172/1964. Sube por 4ª semana (+141. Las semanas anteriores +104, +208, +108, -563).
Rt (tasa de transmisión, nº de personas a los que contagia un contagiado): 1,07/1,12/1,09 Seguimos por encima de 1, pero bajando.
Riesgo de rebrote (cifra de contagiados por 100.000h con transmisión libre): 45/45/39/40. Estabilizada. Buena señal y combinación de leve subida del IA y bajada de Rt.

Gráfico 2

Hospitalizaciones: 257/294/383 ¡Sigue el descenso! A pesar del aumento de los activos (-37. Las semanas anteriores -89, -23, -15,).
UCIs: 60/68/77. ¡Sigue bajando! (-8. Las semanas anteriores -9, -6, -15). Gráfico 2.

Positividad test 3,64%/4,60%/3,77%. ¡Desciende después de 3 semanas de subida!
Porcentaje COVID/Camas hospitalarias 1,96%/2,19%/2,27%.
Porcentaje UCIs/Total Camas: 6,24%/7,09%/7,87%. Continúa bajando.

Gráfico 3

Fallecidos (Últ.7d.) 39/35/46/36/72. No conseguimos bajar de una media de 35/40 (+4. Las semanas anteriores -11, +10, -36).
Activos 3954/3720/3522. Sube por 4ª semana. Mantenemos la alerta. (+234. Las semanas anteriores +198, +98, +232, -182). Gráfico 3

Xàtiva está a fecha 25 de abril en 20,53 de incidencia acumulada (IA). Las semanas anteriores 23,95/34,21/47,98. Ha bajado hasta la mitad de la Comunidad. Bien.


¿ACCIDENTE (lo del Colegio Mayor Ausiàs March), INCONSCIENCIA o TENDENCIA? Con muchísimas probabilidades lo primero. Si no hubiera habido este brote con más de 100 nuevos contagios, las cifras serían mucho mejores. Así y todo, hay que estar atentos a la subida continua de activos (hasta los 3954, cifras del 10 de marzo) a que la Rt está por encima de 1 (1,07), ha aumentado hasta 42,69 la IA (llegó a estar en 25), y los nuevos contagios en los últimos días (2417, +141) sube por 4ª semana. AUNQUE TODO CON CIFRAS ABSOLUTAS MUY BAJAS y muy inferiores a las de España y otras autonomías. Por el contrario, y para bien, siguen bajando las hospitalizaciones y UCIs. Esperemos que todo quede en un SUSTO. Si juntamos esto a la buena marcha (por ahora) de la vacuna, algún dirigente ya estará salivando. Yo me esperaría al menos una semana a ver si todo queda en un accidente.

ESPAÑA:
Gráfico 4

Nuevos contagios por PCR+: 60294/59.292/58600. Leve subida. (+1002, UN +1,7%. Las semanas anteriores un +1,2%. +39,1%). Gráfico 4.

Rt: 1,01/1,18/1,19. Nos acercamos al 1. No bajemos la guardia.
Riesgo de rebrote: 235. Las semanas anteriores 272/234,185. Baja después de varias semanas subiendo.
Fallecidos (Últ.7d.): 639/591/714. Vuelve a subir (+48.. Las semanas anteriores -123, +108, -955).

“Ranking” autonómico de nuevos contagiados con prueba PCR+ en los últimos 14 (de lunes a lunes).

País Vasco (529, +99)
Madrid (396, -8) Rt 0,98
Navarra (363, -55)
Cataluña (280, +36) Rt. 1,10
............
Media nacional (233, +2). Sube por 5ª semana. Rt. 1,01
..............
Murcia (68, +2)
Baleares (58, -4)
C. Valenciana (43, +3) Rt. 1,07

CASI TSUNAMI EN EL PAIS VASCO. OLA EQUIVALENTE A LA 2ª EN VARIAS AUTONOMÍAS Y OLITA EN LAS DEMÁS. TODOS IGUALES, TODOS DIFERENTES. Definitivamente, no habrá Tsunami en el conjunto en este contexto. Suben los nuevos contagios (hasta los 60294, +1002), un +1,7%, muy parecido a la semana anterior. Igual que aquí, la curva está aplanada con pequeña pendiente ascendente, pero con cifras absolutas mucho más altas. El ascenso en IA de algunas autonomías se compensa con el descenso en otras. Buena noticia es que el riesgo de rebrote ha disminuido (hasta 235). Habrá que esperar a ver qué ocurre con las autonomías con cifras más altas, la relajación de medidas y el ritmo de las vacunas. Hay 7 autonomías con un IA superior a 250 (semáforo rojo). Veremos.

Gráfico 5

LOS CAUTOS RARA VEZ SE EQUIVOCAN (Confucio). Vacunas y controles. No hay más hasta que se alcance la inmunidad de rebaño y no salga alguna variante del virus que sea inmune a las vacunas conocidas. ¡Pero ahora, ya se atisba el fina! Y, dicho sea de paso, es el momento de que el mundo desarrollado empiece a pensar que no puede ser una isla en un planeta con 8.000 millones de personas. ¡Liberad patentes vacunas!


20210423

Antonie van Leeuwenhoek: biografía de este científico neerlandés.


Un resumen de la vida de Antonie van Leeuwenhoek, padre de la Microbiología.

El mundo de la microbiología condiciona nuestra existencia, aunque no seamos capaces de observar a sus integrantes a simple vista. Las bacterias son los segundos mayores productores de carbono en la Tierra, pues aportan ni más ni menos que 70 gigatoneladas de materia orgánica global, es decir, el 15% de la presente en todos los ecosistemas. Desde la síntesis de oxígeno hasta la regulación de ciclos biogeoquímicos, las bacterias y arqueas son esenciales para la vida.

De todas formas, tampoco hace falta irse muy lejos para descubrir la funcionalidad de estos seres microscópicos fascinantes. Dentro de nuestro aparato gastrointestinal prolifera un verdadero ecosistema microbiano especializado, que nos ayuda a digerir alimentos de origen vegetal, previene la colonización de agentes patógenos y, además, guía a nuestro sistema inmune en las primeras etapas vitales hacia el camino de la especialización. Desde la piel hasta el intestino, podemos percibir una realidad innegable: somos, en parte, nuestros microorganismos.

Para correr en el ámbito de la investigación microbiológica como hacemos a día de hoy, alguien tuvo que andar en un pasado y sentar las bases de lo que ahora percibimos como obvio. Quédate con nosotros, pues hoy te lo contamos todo sobre Antonie Philips van Leeuwenhoek, o...

Samuel Antonio Sánchez Amador

20210414

Evolución de la Pandemia


Día 13 de abril 2021. 1 año y 30 días después del primer Estado de Alarma

Evolución datos Coronavirus. (Las cifras representan datos acumulados de las tres últimas semanas, de lunes a lunes, separados por barras):

C.VALENCIANA:

Gráfico 1

Nuevos contagios detectados por todo tipo de test en una semana: 1130/1041/944. Tres semanas subiendo (+89, un +8,5%. Las semanas anteriores +10,3%,+4%, -39,1%). Gráfico 1.

Nuevos contagios detectados por PCR+ y antígenos (últ.14 días): 2172/1964/1856. Sube por 2ª semana (+208. Las semanas anteriores +108, -563, -1477, -2001). 
Rt (tasa de transmisión, nº de personas a los que contagia un contagiado): 1,09/1,23/0,86. Seguimos en alerta, pero hemos suavizado el color. 
Riesgo de rebrote (cifra de contagiados por 100.000 habitantes con transmisión libre): 39/40/23. Rompiendo pronósticos, baja. Y es muy difícil.

Gráfico 2

Hospitalizaciones: 383/406/421 ¡Sigue el descenso! Lento. (-23. Las semanas anteriores -15, -77, -71, -175). 
UCIs: 77/83/98. ¡Sigue bajando! (-6. Las semanas anteriores -15, -21, -36, -36). Gráfico 2.

Positividad test 3,77%/3,47%/3,10%/3,61%. Sube por 2ª semana. Hay que conseguir que se estabilice o descienda. 2ª alerta
Porcentaje COVID/Camas hospitalarias 2,27%/2,48%/2,51%. La segunda Comunidad con datos más bajos.
Porcentaje UCIs/Total Camas: 7,87%/8,18%/8,96%. Continúa bajando. En quinta posición.

Gráfico 3

Fallecidos (Últ.7d.) 46/36/72/64. Aumenta. (+10. Las semanas anteriores -36, +8, -35, -60). 
Activos 3522/3424/3192/3374. Sube por segunda semana. 3ª alerta. (+98. Las semanas anteriores +232, -182, -887, -1343, -2463). Gráfico 3

Xàtiva está a fecha 10 de abril en 34,21 de incidencia acumulada (IA). Las semanas anteriores 47,98/58,16/41,05/47,87/44,47. Ha bajado. Vamos bien.

HASTA LO INESPERADO ACABA EN COSTUMBRE CUANDO SE HA APRENDIDO A SOPORTAR (Novela “Todos los fuegos el fuego” de Julio Cortázar). Ya nos hemos acostumbrado a lo inesperado (usar mascarilla, no reuniones en interiores, no abrazar). Así que sigamos así por ahora. Los datos empeoran un poco, pero menos de lo esperado. Algo bueno estaremos haciendo aquí. Suben los contagios (hasta 1130), pero en menor porcentaje. La Rt está en 1,09, pero mejor que la semana pasada. Incluso el riesgo de rebrote se ha estabilizado, cuando lo normal es que hubiera subido levemente. Siguen habiendo señales de peligro, pero por ahora parece que controlado. Lo peor que podríamos hacer es levantar restricciones sin control. Hay que esperar a la semana que viene para empezar a planteárselo y siempre pensando que no somos una isla en España.

ESPAÑA:

Gráfico 4

Nuevos contagios por PCR+: 58600/42129/41500. Subida importante. (+16471, un +39,1%. Las semanas anteriores +1,5%, +21%, -1%). Alarma. Gráfico 4. 

Rt: 1,19/1,12/1,13/1,01. Máxima alarma.
Riesgo de rebrote: 234 
Hospitalizaciones (Últ.7d.):2405/2005/1748. Suben ya por 2ª semana y considerablemente. (+400. Las semanas anteriores +302, +7, -103, -36). 
Fallecidos (Últ.7d.): 714/606/1561. Suben a más de 100 diarias (+108. Las semanas anteriores -955, +382, +349, -1088). 
UCI (Últ.7d.): 270/222/196.Vuelve a subir por 4ª semana (+48)

“Ranking” autonómico de nuevos contagiados con prueba PCR+ en los últimos 14 (de lunes a lunes). 

Navarra (426, +63) 
Madrid (341, +53) Rt 1,19
País Vasco (330, +57)
Aragón (223, +45) 
............
Media nacional (196, +31). Sube por 3ª semana. Rt. 1,19
..............
Murcia (69, +4)
Baleares (59, -4)
C. Valenciana (36, +3) Rt. 1,09

SOSTENELLA Y NO ENMENDALLA (Alocución popular). Clarísimos los efectos de la Semana Santa y Pascua. Ya están aquí y todos los esperábamos. No caben lamentaciones sino tomar medidas que no se debían haber abandonado. A pesar de los avisos, varias autonomías han preferido “sostener” una menor restricción de movilidad y reuniones y no “enmendar” los errores cometidos en anteriores olas. La subida de nuevos contagios (+16471, un +39,1%) recuerda los inicios de la 2ª ola. La Rt disparada hasta el 1,19 y el riesgo de rebrote en máximos hasta 234. Pero Madrid lo eleva hasta 405 y con la misma Rt. Suben los hospitalizados en los últimos siete días (2405), los fallecidos (714) y las UCIs (270). También aquí serán básicos las cifras de la semana próxima para ver si esta 4ª ola se parece a la 2ª (más probablemente) que a la 3ª. Sobre todo, porque ya hay más personas vacunadas. En dos semanas tendremos clara la tendencia.

Gráfico 5

MEMORIA DE PEZ, es decir, nula de solemnidad. Es la que tenemos muchas personas de a pie y la mayoría de las personas que nos gobiernan. Hemos cometido, a escala nacional, el mismo error que la 2ª y 3ª ola (la primera no cuenta por inesperada). Anular restricciones cuando la tasa de transmisión y la incidencia acumulada estaban en fase ascendente. O no aprendemos o no queremos aprender. No sé que es peor. Por eso tiene más valor actitudes más responsables por parte de gobernantes y ciudadanos. Ahora toca revertir los daños de Semana Santa y Pascual. Con ayuda de la vacunación y permiso de nuevos acontecimientos imprevistos. Veremos.


Así son los cálculos de riesgo y beneficio con la vacuna de AstraZeneca

El virus del coronavirus al microscopio NIAID

Buenos días. Hoy escribo de los cálculos sobre los riesgos y beneficios de la vacuna de AstraZeneca. Es un ejemplo útil de cómo se están tomando decisiones en situaciones de incertidumbre.


Esta semana la Agencia Europea del Medicamento ha incluido la posibilidad de que, entre los posibles efectos secundarios de la vacuna de AstraZeneca contra la COVID, aparezcan casos de trombos “muy raros”. Pero lo ha hecho subrayando que el riesgo es pequeño y recomendando que siga su uso. Es lo mismo que ha concluido la agencia británica, aunque hace una excepción con los menores de 30 años: la enfermedad causada por el coronavirus es menos grave para ellos, el equilibrio cambia y recomiendan que se dé prioridad al uso de otra vacuna en este grupo de edad.

La consecuencia en España es que Sanidad y las comunidades han acordado no vacunar con AstraZeneca a los menores de 60 años. Es una decisión más sencilla en nuestro país, por un motivo: tenemos millones de personas de 60, 70 y 80 años sin inmunizar. De momento, ayer España ya decidió elevar la edad para vacunar con AstraZeneca a personas de 60 a 69 años.

¿Pero en qué basan sus recomendaciones los reguladores europeo y británico? Sus cálculos son un caso típico de análisis de riesgo.
Los cálculos en Reino Unido

La agencia británica ha sido ejemplar en su comunicación de este asunto. En su rueda de prensa presentaron unos escenarios para comparar ...


Las 8 verdades (con datos) de la vacuna de AstraZeneca


La proliferación de noticias preocupantes sobre los posibles efectos adversos de la vacuna de Oxford AstraZeneca está consiguiendo que bastantes personas se estén negando a vacunarse con esa «marca» maldita.

Además, muchos de los que reciben la primera dosis lo hacen angustiados, en mayor o menor medida, por el miedo a si tendrán o no la mala suerte de sufrir serios problemas tras la vacunación.

Hace dos días la Base de datos Europea sobre posibles efectos adversos de las vacunas recogía que en España 2.599 personas se han quejado de dolores musculares y de malestar general tras vacunarse con AstraZeneca. Es una estadística que sin duda refuerza la gran preocupación de la gente.

Pero lo que de verdad inquieta a nuestros gestores es saber si la vacuna de AstraZeneca produce ...


20210413

CRISPR-CAS9


En la película Gattaca, del ya lejano año 1997, se ilustraba una sociedad futura en la cual la mayor parte de los niños eran concebidos in vitro y con técnicas de selección genética que permitían a los padres “diseñar” su progenie de manera que estos contaran con todas las características deseables de ambos progenitores y sin ninguna que pudiera ser perjudicial, incluyendo enfermedades con componentes hereditarios como el asma. ¿Qué tan cerca estamos hoy en día de esa realidad? En el siguiente artículo lo vamos a descubrir.

El acrónimo CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats), que puede traducirse como “Repeticiones Palindrómicas Cortas Agrupadas y Regularmente Interespaciadas” hace referencia una serie de secuencias de ADN que precisamente cuentan con esas características; se “leen” igual en sentido 5’-3’ y en sentido 3’-5’ (Figura 1) y están repetidas y separadas en forma regular a lo largo del genoma de muchas bacterias, en las cuales constituyen una mecanismo de defensa ante infecciones víricas, conjuntamente con una serie de proteínas con actividad endonucleasa conocidas como Cas (CRISPR-associated), de las cuales la primera en ser utilizada en aplicaciones biotecnológicas fue la Cas 9, aunque en la actualidad se han descrito otras, por lo cual muchas veces se hace referencia a este mecanismo como CRISPR-Cas o simplemente sistema CRISPR. De manera concreta, en la naturaleza los sistemas CRISPR-Cas son sistemas de respuesta inmune adaptativa procariota que se encuentran en una amplia proporción de las especies bacterianas y en casi todas las especies de arqueas que se han secuenciado hasta la fecha.

Figura 1. Ejemplo de una secuencia 
palindrómica de ADN.

La maquinaria molecular involucrada en la inmunidad adquirida por el mecanismo CRISPR-Cas está codificada por el locus CRISPR como dos conjuntos de componentes genéticos que a menudo se...