Evolución de la Pandemia

Día 3 de Agosto de 2021. 86 días después del fin del 2º Estado de Alarma

Evolución datos Coronavirus. (Las cifras representan datos acumulados de las tres últimas semanas, de lunes a lunes, separados por barras):

C.VALENCIANA:

Gráfico 1

Nuevos contagios detectados por todo tipo de test en una semana: 15978/17353/15360. Gráfico 1.

Nuevos contagios detectados por PCR+ y antígenos (últ.14 días):33332/32714/26951

Rt (tasa de transmisión, nº de personas a los que contagia un contagiado): 0,97/1,18/1,32.
Riesgo de rebrote (cifra de contagiados por 100.000 h con transmisión libre): 552/694/652.

Gráfico 2

Hospitalizaciones: 682/697/517.

UCIs: 111/92/69/48. Gráfico 2.

Positividad test 17,67%/17,83%/16,39%.
Porcentaje COVID/Camas hospitalarias 6,56%/6,73%/5,12%.
Porcentaje UCIs/Total Camas: 15,55%/12,36%/9,08%.

Gráfico 3

Fallecidos (Últ.7d.) 23/17/5.

Activos 28907/29684/25056. Gráfico 3

Xàtiva está a fecha 1 de agosto en 614,79 (182 casos) de incidencia acumulada (IA). Las semanas anteriores 590,76/388,21/232,93/87,77/6,75/0.

ESPAÑA:

Gráfico 4

Nuevos contagios por PCR+: 154857/179317/174052. Gráfico 4.

Rt: 0,93/1,13/1,49.
Riesgo de rebrote: 609/792/927.
Fallecidos (Últ.7d.): 450/175/115.

“Ranking” autonómico de nuevos contagiados con prueba PCR+ en los últimos 14 (de lunes a lunes).

Baleares (916, +30).
Navarra (789, -190)
Cataluña (769, -311)
La Rioja (751, +53)
............
Media nacional (654, -48).
Media nacional franja edad 20-29 años (1859, +0)
.............
CV (569, -17)
.............
Cast-La Mancha (472, +101)
Murcia (473, +49)
Asturias (463, -159)

Gráfico 5

Durante el mes de Agosto únicamente se publicarán los gráficos y los datos, sin comentarios.

Ildefonso Suárez

Parecidos razonables entre patógenos bacterianos oportunistas.

Ariadna Fernández-Calvet, Nahikari López-López, 

Junkal Garmendia, Begoña Euba y Celia Gil-Campillo

Los patógenos oportunistas colonizadores están excelentemente adaptados al huésped que colonizan, a menudo con rango de hospedador restringido a una sola especie y formando parte de su microbioma. Sin embargo, en determinadas circunstancias, a menudo relacionadas con estados de inmunosupresión del huésped, la colonización asintomática se convierte en infección sintomática (Price et al. 2017). La secuenciación de genomas completos ha revelado rasgos genómicos de patoadaptación que, en algunos casos, son comunes a patógenos oportunistas que colonizan nichos distintos en el mismo hospedador, lo que genera parecidos razonables muy interesantes biológica y evolutivamente.

En nuestro grupo de investigación, trabajamos para descifrar los mecanismos de pato-adaptación de la bacteria Gram negativa Haemophilus influenzae, un patógeno oportunista colonizador asintomático de la nasofaringe humana, y causante de infección sintomática en las vías respiratorias bajas de individuos que sufren patologías respiratorias crónicas como la enfermedad pulmonar obstructiva crónica (EPOC) (Su et al. 2018). El análisis genómico comparado nos ha revelado la enorme variabilidad existente entre aislados descapsulados de esta bacteria, traducido en una heterogeneidad fenotípica significativa. La plasticidad genómica de H. influenzae está mediada, entre otros, por la competencia natural, consistente en la captación de ADN lineal de doble cadena exógeno, que atraviesa las membranas externa e interna, accede al citosol bacteriano como ADN monocadena y, según el grado de homología, puede integrarse en el cromosoma bacteriano mediante doble recombinación homóloga (Mell et al. 2014). Además, H. influenzae experimenta variación de fase, un fenómeno estocástico, reversible y de alta frecuencia, determinado por la existencia de repeticiones de secuencia simple (del inglés, single sequence repeats – SSR), cuyo número puede variar entre generaciones debido a errores de la ADN polimerasa durante la replicación de ADN. La presencia de SSRs en genes que codifican estructuras de superficie contribuye a la variabilidad antigénica y al mimetismo molecular del patógeno. H. influenzae también presenta sistemas de regulación epigenética regulados por variación de fase. Así, la variación de fase en genes que codifican DNA metiltransferasas genera cambios en el patrón global de metilación, que a su vez regulan el perfil global de expresión génica del patógeno (Phillips et al. 2019).

La evidencia disponible relaciona la plasticidad genómica de H. influenzae con rasgos de...

Sociedad Española de Microbiología

Un frotis para flora y citología. Se forman cocos en la cantidad total de microbios. Cómo "leer" el análisis de la disbiosis.

Funciones de la flora intestinal obligada

Se sabe que las bacterias se encuentran en todas partes del mundo que nos rodea, y durante un largo período evolutivo de existencia cercana del hombre y los microorganismos, se han formado sistemas simbióticos (mutuamente beneficiosos), cuyos componentes son la microflora, un macroorganismo y Ambiente... Como resultado del proceso evolutivo, todos los órganos humanos que se comunican con ambiente externo, habitado por microorganismos: piel, tracto gastrointestinal (TGI), membranas mucosas, vagina. Normalmente, esta asociación se encuentra en un estado de equilibrio ecológico: eubiosis y se caracteriza por la unidad, la integridad y la capacidad de autorregulación. Con diferente efectos adversos su microflora reacciona al cuerpo humano cambiando su composición cuantitativa y cualitativa, en manifestaciones extremas que conducen a un desequilibrio: disbiosis.

La disbacteriosis (el término fue introducido por el científico alemán A. Nisle en 1916) es un cambio cualitativo y cuantitativo en la microflora bacteriana del cuerpo, principalmente los intestinos. Sin embargo, debe recordarse que esta condición no es enfermedad independiente y una unidad nosológica.

Sobre la base de muchos años de investigación llevada a cabo en esta área, la microflora intestinal generalmente se divide en varios grupos...

N.N. Taran

Instituto de Investigación Clínica de Nutrición, Academia Rusa de Ciencias Médicas, Moscú

Evolución de la pandemia

Día 20 de julio de 2021. 72 días después del fin del 2º Estado de Alarma

Evolución datos Coronavirus. (Las cifras representan datos acumulados de las tres últimas semanas, de lunes a lunes, separados por barras):

C.VALENCIANA:

Gráfico 1

Nuevos contagios detectados por todo tipo de test en una semana: 15360/11589/8272. Suma i sigue, pero reduciendo el incremento (+3771, un 32,5%. Las semanas anteriores +40,1%, +170,7%, +108,2%). Gráfico 1. 

Debería descender más rápidamente. Peor sería que se incrementara!

Nuevos contagios detectados por PCR+ y antígenos (últ.14 días): 26951/19865/11331 (+7086. Las semanas anteriores +8534, +6807, +1928). ¡Se frena!

Rt (tasa de transmisión, nº de personas a los que contagia un contagiado): 1,32/1,70/2,60. Parece confirmarse la reducción de la semana anterior.

Riesgo de rebrote (cifra de contagiados por 100.000h con transmisión libre): 652/626/564/154. También se confirma la ralentización del incremento

Gráfico 2

Hospitalizaciones: 517/367/244/129. Se mantiene el incremento total, pero desciende el relativo (+150. Las semanas anteriores +123, +115, +24).

UCIs: 69/48/24. (+21. Las semanas anteriores +24, +8, 0). Igual que las hospitalizaciones. Gráfico 2.

Positividad test 16,39%/13,43%/10,44%.

Porcentaje COVID/Camas hospitalarias 5,12%/3,45%/2,69%.

Porcentaje UCIs/Total Camas: 9,08%/5,88%/3,65%.

Gráfico 3

Fallecidos (Últ.7d.) 5/5/9. Importante que no se incremente-

Activos 25056/18572/10901 (+6484. Las semanas anteriores +7671, +6848, +1931). Se ralentiza el incremento. Gráfico 3

Xàtiva está a fecha 20 de julio en 388,21 (115 casos) de incidencia acumulada (IA). Las semanas anteriores 232,93/87,77/6,75/0.

UNA (o varias) DE CAL Y DE ARENA (refranero castellano).

Las de cal. Sigue descendiendo la Rt (1,32), se paraliza el riesgo de rebrote, se ralentiza el incremento porcentual de varios parámetros, los nuevos contagiados por semana (+3771), los activos (25056), y se mantienen los fallecimientos (5).

Las de arena. Las cifras globales se incrementan mucho porque ya partimos de una base numérica más amplia, siguen subiendo el porcentaje de test positivos (16,39%), el de camas COVID (5,12%, llegamos a estar menos de 1%), camas UCI (9,08%, estamos en mitad de la tabla) y, sobre todo, sigue aumentando el número de hospitalizaciones (517) y de personas ingresadas en UCI (69), si bien el porcentaje hospitalizados/activos se mantiene alrededor del 2% (durante la 3ª ola llegó al 13%). Aguantemos la respiración y esperemos que en un par de semanas le demos la vuelta a esta situación.

ESPAÑA:

Gráfico 4

Nuevos contagios por PCR+: 174052/134472/80879. (+39580, un +29,4%. Las semanas anteriores +66,3%, +160,5%, +32,2%). Parecida evolución a la nuestra. Gráfico 4.

Rt: 1,49/1,64/2,11.

Riesgo de rebrote: 927/775/475.

Fallecidos (Últ.7d.): 115/81/123.

“Ranking” autonómico de nuevos contagiados con prueba PCR+ en los últimos 14 (de lunes a lunes).

Cataluña (1240, +226) Rt:1,22 (2,06/3,34). Riesgo de rebrote: 1517 (2087/1648).

Castilla-León (910, +196)

Navarra (905, +274)

Aragón (793, +329)

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Media nacional (622, +110). La más alta de la UE (según tabla del Ministerio)

Media nacional franja edad 20-29 años (1838, +417)

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Comunidad Valenciana (496, +110)

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Canarias (352, +101)

Murcia (297, +125)

Cast-La Mancha (235, +108))

NI CILICIOS NI ALARACAS, PERO FRENO Y MARCHA ATRÁS. Referido a las autonomías y Europa. Hay ocho de ellas por encima de 500 de IA, entre ellas Madrid (514) y Cataluña (1240). Las otras dos más pobladas son Andalucía (416) y CV (496). Cataluña y la CV están alcanzando su pico de incidencia, a las otras dos aún le queda. Todo ello hace que a las cifras absolutas aún le quede un largo recorrido al alza. Pero también es cierto que el ritmo de incremento de nuevos contagios está disminuyendo (+39589, un 29,4%), también la Rt (1,49), aunque a menor ritmo del previsto y se frena el incremento porcentual del riesgo de rebrote. Por contra han vuelto a subir los fallecimientos, las hospitalizaciones y las UCIs. Ante ello, no ha habido y no hay más remedio que aumentar el ritmo de vacunación (si es posible), y volver a restricciones que creíamos ya superadas. Es lo que hay.

Gráfico 5

NO APRENDEMOS. Nuestra Comunidad avisó y le siguió Cataluña. Las reuniones sociales y la movilidad sin control (S. Juan, Verano y playa) disparan los contagios. Otras autonomías no hicieron demasiado caso y ahora nos acompañan con altas incidencia que van para arriba, cuando los que lo iniciamos ya vamos de frenada y/o hacia atrás. No hay que sacar pecho nunca. Donde las dan, las toman.

Ildefonso Suárez

IMDEA Agua a fondo: Contaminación microbiológica y cianobacterias

El grupo de contaminación microbiológica y cianobacterias, liderado por María Blanca Sánchez Martínez, se centra en dos líneas de investigación.

El mantenimiento de la salubridad del agua es un tema de creciente interés debido al empeoramiento de su calidad en muchos ecosistemas acuáticos. En este contexto, la abundancia de ciertos microorganismos nocivos (p. ej. bacterias, virus y protozoos) en aguas recreativas y destinadas a consumo, supone un grave riesgo para el medio ambiente y la salud de animales y seres humanos.

Dentro de los microorganismos nocivos no infecciosos, las cianobacterias requieren especial atención. Estas bacterias fotosintéticas se encuentran presentes en la práctica totalidad de nuestro planeta y juegan un papel importante en el ciclo global de nutrientes. Tienen aplicaciones biotecnológicas y médicas; sin embargo, algunas especies producen una amplia gama de compuestos tóxicos, que pueden afectar a diferentes órganos y tejidos, y entre las cuales destacan las microcistinas – toxinas hepáticas cuya presencia en agua potable no puede superar más de 1 µg/L, según las recomendaciones de la Organización Mundial de la Salud (OMS) –.

La proliferación masiva de cianobacterias tóxicas en las masas de agua, fenómeno conocido como floraciones de algas nocivas o harmful algae blooms, tiene implicaciones ambientales, económicas y de salud pública, que son estudiadas por el grupo de contaminación microbiológica y cianobacterias de IMDEA Agua. Entre las tareas concretas llevadas a cabo por este equipo, se encuentra el diseño de programas de monitoreo para el seguimiento de los afloramientos en tiempo real en masas de agua continentales, y el desarrollo de tecnologías para eliminar microcistinas a bajo coste y...

IMDEA Agua

RETEMA